[ Paquet source : seqan-raptor ]
Paquet : seqan-raptor (3.0.1+ds-5 et autres)
Liens pour seqan-raptor
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source seqan-raptor :
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-5.dsc]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds.orig.tar.xz]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-5.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences
Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.
Autres paquets associés à seqan-raptor
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
-
- dep: libyaml-cpp0.8 (>= 0.7.0)
- YAML parser and emitter for C++
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Bibliothèque de compression - binaires
-
- sug: cwl-runner
- paquet virtuel fourni par cwltool
Télécharger seqan-raptor
| Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|---|
| riscv64 | 3.0.1+ds-5+b1 | 620,9 ko | 1 560,0 ko | [liste des fichiers] |