[ Paquet source : pycoqc ]
Paquet : pycoqc (2.5.2+dfsg-3)
Liens pour pycoqc
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source pycoqc :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Andreas Tille (Page QA)
- Nilesh Patra (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
computes metrics and generates Interactive QC plots
PycoQC computes metrics and generates interactive QC plots for Oxford Nanopore technologies sequencing data
PycoQC relies on the sequencing_summary.txt file generated by Albacore and Guppy, but if needed it can also generates a summary file from basecalled fast5 files. The package supports 1D and 1D2 runs generated with Minion, Gridion and Promethion devices and basecalled with Albacore 1.2.1+ or Guppy 2.1.3+
Autres paquets associés à pycoqc
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
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- dep: python3-h5py
- general-purpose Python interface to hdf5
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- dep: python3-h5py-serial
- general-purpose Python interface to hdf5 (Python 3 serial)
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- dep: python3-jinja2
- small but fast and easy to use stand-alone template engine
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- dep: python3-numpy
- gestion rapide des tableaux pour le langage Python – Python 3
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- dep: python3-pandas
- structures de données pour des données « relationnelles » ou « étiquetées »
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- dep: python3-plotly (>= 4.1.0)
- Python 3 plotting library for publication-quality graphs
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- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
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- dep: python3-scipy
- outils scientifiques pour Python 3
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- dep: python3-tqdm
- fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool
Télécharger pycoqc
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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| all | 35,4 ko | 194,0 ko | [liste des fichiers] |