Paquet : r-bioc-edger (4.2.2+dfsg-1)

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analyse empirique de données numériques d’expressions de gène avec R

Il s’agit d’un paquet de Bioconductor pour l’analyse différentielle des expressions de tout le séquençage du transcriptome (RNA-seq) et des profils numériques d’expressions de gène avec réplication biologique. Il utilise l’estimation empirique de Bayes et des tests exacts basés sur la loi binomiale négative. Il est aussi utile pour l’analyse différentielle de signaux avec d’autres types de données de dénombrement à l’échelle du génome.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::r, interface::commandline, Rôle: Programme

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dep: libc6 (>= 2.29)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: liblapack3

bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée

ou liblapack.so.3

paquet virtuel fourni par liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libstdc++6 (>= 14)

bibliothèque standard C++ de GNU v3
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paquet virtuel fourni par r-base-core
dep: r-api-bioc-3.19

paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics
dep: r-bioc-limma (>= 3.41.5)

modèles linéaires pour des données de biopuce (microarray)
dep: r-cran-locfit

GNU R local regression, likelihood and density estimation
dep: r-cran-rcpp

GNU R package for Seamless R and C++ Integration

sug: r-bioc-annotationdbi

GNU R Annotation Database Interface pour BioConductor
sug: r-bioc-biobase

fonctions de base pour Bioconductor
sug: r-bioc-biocstyle

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sug: r-bioc-org.hs.eg.db

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sug: r-cran-jsonlite

Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R
sug: r-cran-knitr

GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
sug: r-cran-matrix

paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses
sug: r-cran-readr

GNU R package to read rectangular text data
sug: r-cran-seuratobject

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