Paquet : fastq-pair (1.0-3)

réécriture des appairages fastq pour que toutes les lectures aient une partenaire et éviter les singletons

Ce paquet réécrit les fichiers fastq avec les séquences ordonnées, avec un établissement de correspondances de fichiers pour deux fichiers fournis sur la ligne de commande, et alors toutes lectures uniques sans correspondance sont placées dans deux fichiers séparés, un pour chaque fichier originel.

Ce code est conçu pour être plus rapide, mieux utiliser la mémoire et fonctionner avec de gros fichiers fastq. Il ne stocke pas le fichier entier en mémoire, mais plutôt stocke les emplacements de chacun des index dans le premier fichier fourni en mémoire.

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