Paquet : libtfbs-perl (0.7.1+ds-4)
Liens pour libtfbs-perl
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source libtfbs-perl :
- [libtfbs-perl_0.7.1+ds-4.dsc]
- [libtfbs-perl_0.7.1+ds.orig.tar.xz]
- [libtfbs-perl_0.7.1+ds-4.debian.tar.xz]
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Steffen Moeller (Page QA)
- Charles Plessy (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [tfbs.genereg.net]
Paquets similaires :
scanning DNA sequence with a position weight matrix
The TFBS perl modules comprise a set of routines to interact with the Transfac and Jaspar databases that describe a special family of proteins, the transcription factors. These bind to genomic DNA to initiate (or prevent) the readout of a gene. Once multiple binding sites are known for a transcription factor, these are gathered in a single file and are aligned in order to find position-specific characteristica that might be used to predict such binding events in novel DNA sequences.
If you use TFBS in your work, please cite "Lenhard B., Wasserman W.W. (2002) TFBS: Computational framework for transcription factor binding site analysis. Bioinformatics 18:1135-1136".
Note: the TFBS perl module is no longer under active development. All the functionality can be found in the TFBSTools Bioconductor package; users are highly encouraged to switch. <http://bioconductor.org/packages/TFBSTools/>
Autres paquets associés à libtfbs-perl
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- dep: bioperl
- outils en Perl pour la bio-informatique
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- dep: libc6 (>= 2.38)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libdbi-perl
- interface base de données en Perl (DBI)
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- dep: libwww-perl
- interface simple et cohérente au world-wide web
-
- dep: pdl (>= 1:2.089-1)
- langage de données Perl : extensions de Perl pour le calcul numérique
-
- dep: perl (>= 5.38.2-5)
- langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
-
- dep: perlapi-5.38.2 [non armel, armhf]
- paquet virtuel fourni par perl-base
-
- dep: perlapi-5.38.2t64 [armel, armhf]
- paquet virtuel fourni par perl-base
-
- rec: libgd-gd2-perl
- paquet virtuel fourni par libgd-perl
- ou libgd-gd2-noxpm-perl
- paquet virtuel fourni par libgd-perl
Télécharger libtfbs-perl
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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amd64 | 218,2 ko | 980,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 218,6 ko | 1 028,0 ko | [liste des fichiers] |
armel | 219,3 ko | 980,0 ko | [liste des fichiers] |
armhf | 217,7 ko | 976,0 ko | [liste des fichiers] |
i386 | 218,9 ko | 980,0 ko | [liste des fichiers] |
mips64el | 218,3 ko | 1 029,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64el | 219,1 ko | 1 028,0 ko | [liste des fichiers] |
riscv64 | 218,8 ko | 976,0 ko | [liste des fichiers] |
s390x | 218,5 ko | 980,0 ko | [liste des fichiers] |