Paquet : flye (2.9.4+dfsg-1)

Liens pour flye

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Paquets similaires :

assembleur de novo pour les lectures de séquençage de molécule unique utilisant un graphe de répétitions

Flye est un assembleur de novo pour les lectures de séquençage de molécule unique, telles que celles produites par PacBio et « Oxford Nanopore Technologies ». Il est conçu pour une large diversité d’ensembles de données, du petit projet concernant des bactéries aux assemblages à l’échelle de mammifères. Ce paquet constitue une chaine complète : il prend en entrée des chaines brutes de PacBio ou ONT et produit des contigs propres. Flye possède aussi un mode spécial pour les assemblages de métagénome.

Autres paquets associés à flye

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.38)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non riscv64]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

bibliothèque standard C++ de GNU v3
dep: minimap2

versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences
dep: python3

langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
dep: python3-six

Python 2 and 3 compatibility library
dep: samtools

traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger flye

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	22 637,6 ko	36 914,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	22 558,7 ko	36 729,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	22 557,9 ko	37 104,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	22 638,1 ko	37 177,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	22 616,0 ko	36 509,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	22 668,1 ko	37 097,0 ko	[liste des fichiers]