Paquet source : spades (3.13.0+dfsg2-2)
Liens pour spades
Ressources Debian :
Responsables :
Ressources externes :
Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :
- spades
- assembleur génomique pour des ensembles de données de « single-cell » et « isolates »
Autres paquets associés à spades
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- adep:
debhelper
(>= 11~)
- programmes assistants pour debian/rules
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- adep:
dh-python
- outils d’assistance pour Debian pour empaqueter les bibliothèques et applications Python
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- adep:
cmake
- système make multiplate-forme
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- adep:
python-all-dev
- package depending on all supported Python2 development packages
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- adep:
zlib1g-dev
- bibliothèque de compression — paquet de développement
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- adep:
libbz2-dev
- Bibliothèque de compression de fichiers par tri de blocs, de haute qualité - développement
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- adep:
libboost-dev
- Boost C++ Libraries development files (default version)
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- adep:
libbam-dev
- manipulation d'alignements de séquences de nucléotides au format BAM ou SAM
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- adep:
libbamtools-dev
- API C++ de manipulation de fichiers BAM (alignement de génomes)
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- adep:
libhat-trie-dev
- en-têtes de développement et bibliothèques statiques pour la bibliothèque HAT-trie
un paquet virtuel est également fourni par
libhat-trie-dev
-
- adep:
libhts-dev
- development files for the HTSlib
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- adep:
libnlopt-dev
- nonlinear optimization library -- development package
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- adep:
libnlopt-cxx-dev
- nonlinear optimization library -- development package for C++
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- adep:
libssw-dev
- Development headers and static libraries for libssw
un paquet virtuel est également fourni par
libssw-dev
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- adep:
python-yaml
- analyseur et générateur de code YAML pour Python
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- adep:
python-joblib
- tools to provide lightweight pipelining in Python
-
- adep:
asciidoctor
(>= 1.5.3)
- rendu AsciiDoc en HTML pour ruby
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- adep:
bwa
- dispositif d'alignement Burrows-Wheeler
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- adep:
libbwa-dev
- fichiers source du dispositif d'alignement Burrows-Wheeler
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- adep:
lynx
- navigateur web non graphique (en mode texte)
