Paquet source : salmon (0.12.0+ds1-1)
Liens pour salmon
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Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :
- salmon
- wicked-fast transcript quantification from RNA-seq data
Autres paquets associés à salmon
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- adep:
debhelper
(>= 11~)
- programmes assistants pour debian/rules
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- adep:
cmake
- système make multiplate-forme
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- adep:
libboost-filesystem-dev
- filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++ (default version)
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- adep:
libboost-system-dev
- Operating system (e.g. diagnostics support) library (default version)
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- adep:
libboost-iostreams-dev
- Boost.Iostreams Library development files (default version)
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- adep:
libboost-thread-dev
- portable C++ multi-threading (default version)
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- adep:
libboost-program-options-dev
- program options library for C++ (default version)
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- adep:
libboost-timer-dev
- C++ wall clock and CPU process timers (default version)
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- adep:
libjellyfish-2.0-dev
(>> 2.2.3-2)
- count k-mers in DNA sequences (development files of jellyfish)
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- adep:
libpthread-stubs0-dev
- éléments de code de gestion « pthreads » non fournis par la libc - fichiers de développement
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- adep:
libsparsehash-dev
- Google's extremely memory-efficient C++ hash_map implementation
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- adep:
libdivsufsort-dev
- libdivsufsort header files
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- adep:
libbwa-dev
- fichiers source du dispositif d'alignement Burrows-Wheeler
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- adep:
pkg-config
- gestion des drapeaux de compilation et d'édition de lien pour les bibliothèques
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- adep:
libjemalloc-dev
- development files and documentation for jemalloc
-
- adep:
libcereal-dev
- C++11 library for serialization
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- adep:
libtbb-dev
- parallelism library for C++ - development files
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- adep:
libgff-dev
- GFF/GTF parsing from cufflinks as a library
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- adep:
libstaden-read-dev
- development files for libstaden-read
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- adep:
libspdlog-dev
- Very fast, header only, C++ logging library
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- adep:
libtclap-dev
- Templatized command-line argument parser for C++
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- adep:
help2man
- Générateur automatique de pages de manuel
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- adep:
sphinx-doc
- générateur de documentation pour les projets en Python – documentation
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- adep:
python3-sphinx
- documentation generator for Python projects (implemented in Python 3)
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- adep:
python3-sphinx-rtd-theme
- sphinx theme from readthedocs.org (Python 3)
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- adep:
zlib1g-dev
- bibliothèque de compression — paquet de développement
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- adep:
libeigen3-dev
- lightweight C++ template library for linear algebra
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- adep:
libbz2-dev
- Bibliothèque de compression de fichiers par tri de blocs, de haute qualité - développement
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- adep:
liblzma-dev
- XZ-format compression library - development files
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- adep:
rapmap-dev
(>= 0.12.0~)
- rapmap - rapid sensitive and accurate DNA read mapping (some headers)
