[ Paquet source : unifrac ]
Paquet : python3-unifrac (1.3-4 et autres)
Liens pour python3-unifrac
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Ressources externes :
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Paquets similaires :
calcul de haute performance de diversité phylogénétique
Il s’agit du dépôt de facto pour le calcul de haute performance de diversité phylogénétique. Les méthodes dans ce dépôt sont basées sur une mise en œuvre de l’algorithme Strided State UniFrac qui est plus rapide et utilise moins de mémoire que Fast UniFrac. Strided State UniFrac prend en charge Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac et meta UniFrac. Ce dépôt inclut aussi Stacked Faith, une méthode pour calculer la diversité phylogénétique de confiance (Faith's PD), qui est plus rapide et utilise moins de mémoire que l’implémentation de référence basée sur Fast UniFrac.
Ce paquet fournit le module Python3.
Autres paquets associés à python3-unifrac
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- dep: cython3 [alpha, m68k]
- extensions en C pour Python 3
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [m68k, mips64el]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [alpha]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
-
- dep: libssu0 (>= 0.10.0) [alpha]
- high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)
- dep: libssu0 (>= 1.1.1) [m68k]
- dep: libssu0 (>= 1.4) [non alpha, m68k]
-
- dep: libstdc++6 (>= 11) [alpha]
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
- dep: python3 (<< 3.11) [alpha]
- dep: python3 (<< 3.12) [m68k]
- dep: python3 (<< 3.14) [non alpha, m68k]
- dep: python3 (>= 3.10~) [alpha, m68k]
- dep: python3 (>= 3.12~) [non alpha, m68k]
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- dep: python3-biom-format
- format de matrice d'observation biologique (BIOM) – Python 3
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- dep: python3-h5py (>= 3.3.0) [non alpha, m68k]
- interface généraliste de Python pour hdf5
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- dep: python3-h5py-serial [alpha, m68k]
- general-purpose Python interface to hdf5 (Python 3 serial)
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- dep: python3-iow [non alpha]
- balanced parentheses tree structure
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- dep: python3-numpy [alpha, m68k]
- Python library for numerical computations (Python 3)
- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [non alpha, m68k]
-
- dep: python3-numpy-abi9 [non alpha, m68k]
- paquet virtuel fourni par python3-numpy
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- dep: python3-skbio [alpha, m68k]
- Python3 data structures, algorithms, educational resources for bioinformatic
- dep: python3-skbio (>= 0.6.1) [non alpha, m68k]
Télécharger python3-unifrac
| Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|---|
| alpha (portage non officiel) | 0.10.0-3 | 106,4 ko | 582,0 ko | [liste des fichiers] |
| amd64 | 1.3-4+b2 | 186,1 ko | 1 022,0 ko | [liste des fichiers] |
| arm64 | 1.3-4+b1 | 158,6 ko | 950,0 ko | [liste des fichiers] |
| m68k (portage non officiel) | 1.1.1-2 | 135,9 ko | 715,0 ko | [liste des fichiers] |
| mips64el | 1.3-4+b1 | 156,2 ko | 1 092,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64el | 1.3-4+b1 | 178,9 ko | 1 078,0 ko | [liste des fichiers] |
| riscv64 | 1.3-4+b1 | 183,7 ko | 870,0 ko | [liste des fichiers] |