Paquet : python3-rdkit (202309.3-4 et autres)

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Ressources externes :

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Paquets similaires :

Collection of cheminformatics and machine-learning software

RDKit is a Python/C++ based cheminformatics and machine-learning software environment. Features Include:

 * Chemical reaction handling and transforms
 * Substructure searching with SMARTS
 * Canonical SMILES
 * Molecule-molecule alignment
 * Large number of molecular descriptors, including topological,
   compositional, EState, SlogP/SMR, VSA and Feature-map vectors
 * Fragmentation using RECAP rules
 * 2D coordinate generation and depiction, including constrained depiction
 * 3D coordinate generation using geometry embedding
 * UFF and MMFF94 forcefields
 * Chirality support, including calculation of (R/S) stereochemistry codes
 * 2D pharmacophore searching
 * Fingerprinting, including Daylight-like, atom pairs, topological
   torsions, Morgan algorithm and MACCS keys
 * Calculation of shape similarity
 * Multi-molecule maximum common substructure
 * Machine-learning via clustering and information theory algorithms
 * Gasteiger-Marsili partial charge calculation

File formats RDKit supports include MDL Mol, PDB, SDF, TDT, SMILES and RDKit binary format.

Autres paquets associés à python3-rdkit

dépendances

recommandations

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enhances

dep: fonts-freefont-ttf

polices TrueType Freefont Serif, Sans et Mono
dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

bibliothèque Boost.Iostreams
dep: libboost-python1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

bibliothèque Boost.Python
dep: libboost-python1.74.0-py39 [hppa]

Paquet indisponible
dep: libboost-python1.83.0 (>= 1.83.0) [non hppa]

bibliothèque Boost.Python
dep: libboost-python1.83.0-py311 [non hppa]

paquet virtuel fourni par libboost-python1.83.0
dep: libboost-regex1.83.0-icu72 [sparc64]

paquet virtuel fourni par libboost-regex1.83.0
dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

bibliothèque de sérialisation pour C++
dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0) [non hppa]

bibliothèque de sérialisation pour C++
dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

bibliothèque de système d'exploitation (par ex. gestion des diagnostics)
dep: libc6 (>= 2.29) [hppa]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.32) [m68k, ppc64, s390x, sparc64]

dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, hppa, m68k, ppc64, s390x, sparc64]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
dep: libcairo2 (>= 1.4.10) [non hppa]

Bibliothèque graphique vectorielle Cairo 2D
dep: libcoordgen3 (>= 3.0.0) [hppa]

2D coordinate generation for chemical compounds

dep: libcoordgen3 (>= 3.0.2) [non hppa]
dep: libfreetype6 (>= 2.2.1) [sparc64]

moteur de fontes FreeType 2, fichiers de bibliothèques partagées
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libmaeparser1 (>= 1.2.4) [hppa]

parser for Schrödinger Maestro files

dep: libmaeparser1 (>= 1.3.1) [sparc64]
dep: libpython3.11 (>= 3.11.5) [alpha, ppc64]

Shared Python runtime library (version 3.11)
dep: libpython3.11t64 (>= 3.11.5) [non alpha, hppa, ppc64]

Shared Python runtime library (version 3.11)
dep: libpython3.9 (>= 3.9.1) [hppa]

Paquet indisponible
dep: librdkit1 [hppa]

Collection of cheminformatics and machine-learning software (shared libraries)

dep: librdkit1 (>= 202309.3) [alpha, ppc64]
dep: librdkit1t64 (>= 202309.3) [non alpha, hppa, ppc64]

Collection of cheminformatics and machine-learning software (shared libraries)
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [non hppa]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 9) [hppa]
dep: python3

langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

dep: python3 (<< 3.10) [hppa]

dep: python3 (<< 3.12) [non hppa]

dep: python3 (>= 3.11~) [non hppa]

dep: python3 (>= 3.9~) [hppa]
dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1) [hppa]

gestion rapide des tableaux pour le langage Python – Python 3

dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0) [alpha, ppc64]

dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [non alpha, hppa, ppc64]
dep: python3-numpy-abi9

paquet virtuel fourni par python3-numpy
dep: rdkit-data

Collection of cheminformatics and machine-learning software (data files)

sug: rdkit-doc

Collection of cheminformatics and machine-learning software (documentation)

Télécharger python3-rdkit

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	202309.3-2	4 303,8 ko	33 944,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	202309.3-4	4 443,4 ko	30 899,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	202309.3-4	4 194,1 ko	31 936,0 ko	[liste des fichiers]
armel	202309.3-4	3 620,2 ko	22 611,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	202309.3-4	3 714,6 ko	20 067,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	202009.5-2	3 843,8 ko	24 156,0 ko	[liste des fichiers]
i386	202309.3-4	4 259,8 ko	24 925,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	202309.3-4	4 126,4 ko	24 065,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	202309.3-4	3 833,5 ko	34 300,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	202309.3-2	4 292,4 ko	36 228,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	202309.3-4	4 337,8 ko	34 819,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	202309.3-4	4 443,4 ko	28 810,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	202309.3-4	4 288,9 ko	30 429,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	202309.3-4	13 629,4 ko	165 799,0 ko	[liste des fichiers]