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[ Paquet source : cctbx ]
Paquet : python3-cctbx (2023.12+ds2+~3.17.0+ds1-4 et autres)
Liens pour python3-cctbx
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source cctbx :
- [cctbx_2023.12+ds2+~3.17.0+ds1-4.dsc]
- [cctbx_2023.12+ds2+~3.17.0+ds1.orig-dxtbx.tar.xz]
- [cctbx_2023.12+ds2+~3.17.0+ds1.orig.tar.xz]
- [cctbx_2023.12+ds2+~3.17.0+ds1-4.debian.tar.xz]
Responsables :
- Debian Science Maintainers (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Picca Frédéric-Emmanuel (Page QA)
- Radostan Riedel (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
boite à outils en Python pour la cristallographie
Il s’agit d’une boîte à outils logicielle pour la cristallographie qui fournit les modules suivants :
– annlib_adaptbx, – boost_adaptbx, – cbflib_adaptbx, – ccp4io_adaptbx :enveloppes pour la fonctionnalité Boost dans CCTBX ; – cctbx : bibliothèques pour les applications de cristallographie, utiles pour la cristallographie de petites molécules et macro-molécules ; – cma_es, – crys3d : modules d’affichage de molécules, de densité d’électrons, et de données de réseau réciproque ; – dxtbx : la boîte à outils d’image de diffraction pour la gestion de détecteur de rayons X de complexité arbitraire pour différents formats standard ; – fable : bibliothèque d’émulation Fortran pour porter Fortran77 vers C++ ; – gltbx : liaisons de Python pour OpenGL ; – iotbx : travailler avec les formats courants de fichier de cristallographie ; – libtbx : le système de construction commun à tous les autres modules. Cela inclut une très fine enveloppe autour de l’outil logiciel de construction SCons. Il fournit aussi des utilitaires et des cadriciels utiles pour simplifier le développement d’application, incluant des outils de régression de test, la parallélisation à travers des systèmes multiprocesseurs et grappes et une syntaxe de configuration modulaire appelée PHIL (Python Hierarchial Interface Language) utilisée pour tout le CCTBX ; – mmtbx : fonctionnalité spécifique à la cristallographie de macro-molécules. Cela comprend toute la machinerie nécessaire pour le réglage des contraintes de géométrie, la correction et la mise à l’échelle de milieu ambiant, l’analyse de données de diffraction macro-moléculaire, le calcul de coefficients de mappage pondérés et la plupart des méthodes mises en œuvre dans phenix.refine. La majorité de l’infrastructure pour le serveur de validation MolProbity (et équivalent Phenix) est aussi située ici ; – omptbx : interface OpenMP ; – rstbx : boîte à outils de réseau réciproque pour autoindexer la diffraction de petites molécules Bragg, les vecteurs de de réseau réciproque indiqués ; – scitbx : calculs généraux scientifiques, incluant une famille de types de tableau C++ de haut niveau, une bibliothèque de transformée de Fourier rapide et un portage en C++ du minimiseur populaire L-BFGS quasi-Newton ; – smtbx : cristallographie de petites molécules ; – spotfinder : – tbxx : – wxtbx : contrôles wxPython utilisés dans l’interface graphique Phenix et utilitaires divers.
Ce paquet fournit une collection sélective de modules python du projet cctbx.
Autres paquets associés à python3-cctbx
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- dep: ca-certificates
- certificats CA courants
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- dep: libantlr3c-3.4-0 [non m68k]
- exécutable en C du générateur d'analyseur ANTLR version 3
un paquet virtuel est également fourni par libantlr3c-antlrdbg-3.4-0 - ou libantlr3c-antlrdbg-3.4-0
- exécutable en C du générateur d'analyseur ANTLR version 3 avec le débogueur ANTLR
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- dep: libboost-numpy1.83.0 (>= 1.83.0) [non m68k]
- extensions NumPy pour Boost.Python
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- dep: libboost-numpy1.83.0-py311 [non m68k]
- paquet virtuel fourni par libboost-numpy1.83.0
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- dep: libboost-numpy1.83.0-py312 [non m68k]
- paquet virtuel fourni par libboost-numpy1.83.0
-
- dep: libboost-python1.83.0 (>= 1.83.0) [non m68k]
- bibliothèque Boost.Python
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- dep: libboost-python1.83.0-py311 [non m68k]
- paquet virtuel fourni par libboost-python1.83.0
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- dep: libboost-python1.83.0-py312 [non m68k]
- paquet virtuel fourni par libboost-python1.83.0
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- dep: libboost-thread1.83.0 (>= 1.83.0) [non m68k]
- multitâche portable pour C++
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- dep: libc6 (>= 2.34) [non m68k]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libcbf1t64 (>= 0.9.7+dfsg1-2~) [non m68k]
- bibliothèque partagée de prise en charge de CBFlib
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- dep: libccp4c0 (>= 8.0.0) [non m68k]
- CCP4 core functionality - C runtime
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- dep: libcctbx-dev (= 2023.12+ds2+~3.17.0+ds1-4) [amd64, ppc64, riscv64]
- Computational Crystallography Toolbox - headers
- dep: libcctbx-dev (= 2023.12+ds2+~3.17.0+ds1-4+b1) [arm64, ppc64el, s390x]
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- dep: libcctbx0 (= 2021.12+ds1-2) [m68k]
- Computational Crystallography Toolbox - runtime libraries
- dep: libcctbx0 (= 2023.12+ds2+~3.17.0+ds1-4) [amd64, ppc64, riscv64]
- dep: libcctbx0 (= 2023.12+ds2+~3.17.0+ds1-4+b1) [arm64, ppc64el, s390x]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.0) [non arm64, m68k, riscv64]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, riscv64]
-
- dep: libgl1 [non m68k]
- bibliothèque de transport GL indépendante du fournisseur – prise en charge de l’ancienne GL
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- dep: libglu1-mesa [non m68k]
- bibliothèque utilitaire Mesa OpenGL (GLU)
- ou libglu1
- paquet virtuel fourni par libglu1-mesa
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- dep: libhdf5-103-1 [ppc64]
- HDF5 C runtime files - serial version
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- dep: libhdf5-103-1t64 [non m68k, ppc64]
- HDF5 C runtime files - serial version
-
- dep: libmmdb2-0 (>= 2.0.22) [non m68k]
- macromolecular coordinate library - runtime
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- dep: libssm2 (>= 1.4.0) [non m68k]
- macromolecular superposition library - runtime
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [non m68k]
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
- dep: python3 (<< 3.13) [non m68k]
- dep: python3 (>= 3.11~) [non m68k]
-
- dep: python3-h5py (>= 3) [non m68k]
- general-purpose Python interface to hdf5
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- dep: python3-matplotlib [non m68k]
- système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab –⋅Python⋅3
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- dep: python3-mrcfile [non m68k]
- Python implementation of the MRC2014 file format
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- dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0) [amd64, ppc64, riscv64]
- gestion rapide des tableaux pour le langage Python – Python 3
- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [arm64, ppc64el, s390x]
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- dep: python3-numpy-abi9 [non m68k]
- paquet virtuel fourni par python3-numpy
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- dep: python3-nxmx [non m68k]
- Read HDF5 data in the NXmx subformat of the NeXus format
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- dep: python3-orderedset [non m68k]
- Ordered Set implementation in Cython.
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- dep: python3-pil [non m68k]
- Python Imaging Library (Python3)
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- dep: python3-pint [non m68k]
- définir, exploiter et manipuler des quantités physiques – Python 3.x
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- dep: python3-procrunner [non m68k]
- Versatile utility function to run external processes from Python
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- dep: python3-pycbf (>= 0.9.7+dfsg1-2~) [non m68k]
- modules de Python pour CBFLib – Python 3
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- dep: python3-pymol [non m68k]
- Molecular Graphics System (Python 3 modules)
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- dep: python3-requests [non m68k]
- bibliothèque HTTP simple et élégante pour Python3, construite pour les êtres humains
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- dep: python3-scipy [non m68k]
- outils scientifiques pour Python 3
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- dep: python3-six [non m68k]
- Python 2 and 3 compatibility library
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- dep: python3-tqdm [non m68k]
- fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool
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- dep: python3-wxgtk4.0 [non m68k]
- interface de Python 3 pour la boite à outils graphiques multiplateforme en C++
Télécharger python3-cctbx
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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amd64 | 2023.12+ds2+~3.17.0+ds1-4 | 48 959,8 ko | 501 959,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 2023.12+ds2+~3.17.0+ds1-4+b1 | 49 927,1 ko | 530 850,0 ko | [liste des fichiers] |
m68k (portage non officiel) | 2021.12+ds1-2 | 728,5 ko | 4 632,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64 (portage non officiel) | 2023.12+ds2+~3.17.0+ds1-4 | 59 243,7 ko | 687 370,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64el | 2023.12+ds2+~3.17.0+ds1-4+b1 | 55 248,1 ko | 586 335,0 ko | [liste des fichiers] |
riscv64 | 2023.12+ds2+~3.17.0+ds1-4 | 51 097,3 ko | 476 489,0 ko | [liste des fichiers] |
s390x | 2023.12+ds2+~3.17.0+ds1-4+b1 | 50 284,4 ko | 526 187,0 ko | [liste des fichiers] |