Paquet : plink2 (2.00~a5.8-231123+dfsg-1 et autres)

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Ressources externes :

Page d'accueil [www.cog-genomics.org]

Paquets similaires :

whole-genome association analysis toolset

plink expects as input the data from SNP (single nucleotide polymorphism) chips of many individuals and their phenotypical description of a disease. It finds associations of single or pairs of DNA variations with a phenotype and can retrieve SNP annotation from an online source.

SNPs can evaluated individually or as pairs for their association with the disease phenotypes. The joint investigation of copy number variations is supported. A variety of statistical tests have been implemented.

plink2 is a comprehensive update of plink and plink1.9 with new algorithms and new methods, faster and less memory consumer than the first plink.

Autres paquets associés à plink2

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, m68k]

bibliothèque de prise en charge fournissant des fonctions internes __atomic
dep: libblas3

implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée

ou libblas.so.3

paquet virtuel fourni par libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libdeflate0 (>= 1.0)

compression et décompression de tampon complet rapide basée sur DEFLATE
dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [riscv64, sparc64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: liblapack3

bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée

ou liblapack.so.3

paquet virtuel fourni par libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [armel, armhf, sparc64]

bibliothèque standard C++ de GNU v3
dep: libzstd1 (>= 1.5.5)

algorithme de compression rapide sans perte
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger plink2

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2.00~a5.8-231123+dfsg-1	1 199,9 ko	3 348,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2.00~a5.8-231123+dfsg-1	2 469,3 ko	16 774,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.00~a5.8-231123+dfsg-1	984,8 ko	2 643,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2.00~a5.8-231123+dfsg-1	946,7 ko	2 657,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2.00~a5.8-231123+dfsg-1	948,1 ko	1 925,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	2.00~a5.8-231123+dfsg-1	1 073,8 ko	2 832,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2.00~a5.8-231123+dfsg-1	1 668,8 ko	12 310,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	2.00~a5.8-231123+dfsg-1	1 504,3 ko	5 769,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	2.00~a5.8-231123+dfsg-1	977,2 ko	2 722,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.00~a5.8-231123+dfsg-1	1 176,2 ko	3 511,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	2.00~a5.8-231123+dfsg-1	1 199,9 ko	3 604,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.00~a5.8-231123+dfsg-1	1 144,2 ko	3 219,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b1	1 267,6 ko	2 636,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2.00~a5.8-231123+dfsg-1	1 241,0 ko	3 367,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	2.00~a5.8-231123+dfsg-1	1 099,0 ko	4 184,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	2.00~a5.8-231123+dfsg-1	1 062,4 ko	2 705,0 ko	[liste des fichiers]