Paquet : plink1.9 (1.90~b7.2-231211-1 et autres)
Liens pour plink1.9
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source plink1.9 :
- [plink1.9_1.90~b7.2-231211-1.dsc]
- [plink1.9_1.90~b7.2-231211.orig.tar.xz]
- [plink1.9_1.90~b7.2-231211-1.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [www.cog-genomics.org]
Paquets similaires :
outils d'analyse d'associations sur le génome entier
Plink traite les données provenant de fragments SNP (single nucleotide polymorphism — polymorphisme d'un seul nucléotide) de nombreux individus et leur description d'un phénotype pathologique. Il trouve les associations entre un phénotype et les variations d'ADN simple ou double brin et il peut récupérer les annotations SNP depuis une ressource en ligne.
Les SNP peuvent être analysés individuellement ou en tant que paires pour leur association avec les phénotypes pathologiques. L'étude conjointe des variations du nombre de copies est prise en charge. Divers tests statistiques ont été implémentés.
Plink1.9 est une mise à jour complète de plink avec de nouveaux algorithmes et de nouvelles méthodes et une utilisation de la mémoire plus faible et rapide que le premier plink.
Il est à noter que l'exécutable a été renommé en plink1.9 en raison d'un conflit de noms. Consulter /usr/share/doc/plink1.9/README.Debian pour plus d'informations.
Autres paquets associés à plink1.9
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- dep: libatlas3-base [hppa, sh4]
- Automatically Tuned Linear Algebra Software — bibliothèques génériques partagées
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- dep: libblas3 [non hppa, sh4]
- implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée
- ou libblas.so.3
- paquet virtuel fourni par libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.19) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.34) [non hppa, sh4]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, x32]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
-
- dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [sh4]
- Paquet indisponible
-
- dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]
- Paquet indisponible
-
- dep: liblapack3
- bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée
- ou liblapack.so.3
- paquet virtuel fourni par libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [non hppa, sh4]
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
- dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [hppa, sh4]
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- Bibliothèque de compression - binaires
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- rec: libopenblas0
- Optimized BLAS (linear algebra) library (meta)
- ou libblis4
- BLAS-like Library Instantiation Software Framework (32bit,meta)
Télécharger plink1.9
| Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 1.90~b7.2-231211-1 | 875,0 ko | 2 134,0 ko | [liste des fichiers] |
| armel | 1.90~b7.2-231211-1 | 783,1 ko | 2 061,0 ko | [liste des fichiers] |
| armhf | 1.90~b7.2-231211-1 | 765,4 ko | 1 449,0 ko | [liste des fichiers] |
| hppa (portage non officiel) | 1.90~b3b-150117-1+b1 | 803,7 ko | 2 006,0 ko | [liste des fichiers] |
| i386 | 1.90~b7.2-231211-1 | 881,9 ko | 2 377,0 ko | [liste des fichiers] |
| sh4 (portage non officiel) | 1.90~b3b-150117-1 | 893,3 ko | 1 716,0 ko | [liste des fichiers] |
| x32 (portage non officiel) | 1.90~b7.2-231211-1 | 874,1 ko | 2 081,0 ko | [liste des fichiers] |