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[ Paquet source : mmseqs2  ]

Paquet : mmseqs2 (15-6f452+ds-2 et autres)

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recherche et partitionnement de protéines ultra rapide et sensible

MMseqs2 (Many-against-Many sequence searching) est une suite logicielle pour rechercher et partitionner des grands ensembles de séquences de protéines ou de nucléotides. MMseqs2 est un logiciel au code source ouvert (licence GPL) implémenté en C++ pour Linux, macOS et (en version bêta à travers cygwin) Windows. Le logiciel est conçu pour fonctionner sur plusieurs cœurs et plusieurs serveurs et se révèle très extensible. MMseqs2 fonctionne 10 000 fois plus rapidement que BLAST. À 100 fois sa vitesse il atteint presque la même sensibilité. Il peut réaliser des recherches de profil avec la même sensibilité que PSI-BLAST à plus de 400 fois sa vitesse.

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mips64el 15-6f452+ds-2+b1 6 933,1 ko16 790,0 ko [liste des fichiers]