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Paquet : metabat (2.15-4 et autres)

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robust statistical framework for reconstructing genomes from metagenomic data

MetaBAT integrates empirical probabilistic distances of genome abundance and tetranucleotide frequency for accurate metagenome binning. MetaBAT outperforms alternative methods in accuracy and computational efficiency on both synthetic and real metagenome datasets. It automatically forms hundreds of high quality genome bins on a very large assembly consisting millions of contigs in a matter of hours on a single node.

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Architecture Version Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 2.15-4+b1 509,2 ko1 880,0 ko [liste des fichiers]
i386 2.15-4+b1 538,4 ko1 923,0 ko [liste des fichiers]
x32 (portage non officiel) 2.15-4+b1 500,0 ko1 706,0 ko [liste des fichiers]