Paquet : libhts3 (1.17+ds-1) [debports]
Liens pour libhts3
Ressources Debian :
Télécharger le paquet source :
IntrouvableResponsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
C library for high-throughput sequencing data formats
HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.
HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension ‘csi’ (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.
Autres paquets associés à libhts3
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- dep: libbz2-1.0
- Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)
- bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec GnuTLS
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- dep: libdeflate0 (>= 1.0)
- compression et décompression de tampon complet rapide basée sur DEFLATE
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- dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)
- Custom compression for CRAM and others
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- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- librairie de compression au format XZ
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- dep: libssl3 (>= 3.0.0)
- trousse à outils SSL - bibliothèques partagées
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Bibliothèque de compression - binaires
Télécharger libhts3
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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| riscv64 (portage non officiel) | 389,8 ko | 781,0 ko | [liste des fichiers] |