Paquet : khmer (2.1.2+dfsg-9) [debports]
Liens pour khmer
Ressources Debian :
Télécharger le paquet source :
IntrouvableResponsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [khmer.readthedocs.org]
Paquets similaires :
comptage k-mer, filtrage et parcours de graphe de séquences d’ADN en mémoire vive
Khmer est une bibliothèque et un ensemble d’outils en ligne de commande pour travailler sur le séquençage d’ADN. Il vise en premier lieu les données de séquençage « short read » telles que produites par la plateforme Illumina. Khmer utilise une approche basée sur k-mer pour l’analyse de séquences, d’où son nom.
Autres paquets associés à khmer
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- dep: cython3 (>= 0.26.1)
- extensions en C pour Python 3
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- dep: khmer-common
- Paquet indisponible
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- dep: libbz2-1.0
- Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)
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- dep: libc6.1 (>= 2.31)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: libunwind8
- bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
- dep: python3 (<< 3.10)
- dep: python3 (>= 3.9~)
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- dep: python3-bz2file
- Paquet indisponible
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- dep: python3-screed (>= 1.0)
- short nucleotide read sequence utils in Python 3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)
- Bibliothèque de compression - binaires
Télécharger khmer
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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| ia64 (portage non officiel) | 6 427,6 ko | 33 935,0 ko | [liste des fichiers] |