Paquet : density-fitness (1.0.8-4 et autres)

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Paquets similaires :

Calculates per-residue electron density scores

The program density-fitness calculates electron density metrics, for main- (includes Cβ atom) and side-chain atoms of individual residues.

For this calculation, the program uses the structure model in either PDB or mmCIF format and the electron density from the 2mFo-DFc and mFo-DFc maps. If these maps are not readily available, the MTZ file and model can be used to calculate maps clipper. Density-fitness support both X-ray and electron diffraction data.

This program is essentially a reimplementation of edstats, a program available from the CCP4 suite. However, the output now contains only the RSR, SRSR and RSCC fields as in edstats with the addition of EDIAm and OPIA and no longer requires pre-calculated map coefficients.

Autres paquets associés à density-fitness

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libboost-date-time1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

ensemble de bibliothèques de date et d'horaire basées sur les concepts génériques de programmation
dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

bibliothèque Boost.Iostreams
dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

bibliothèque d'options de programmes pour C++
dep: libboost-regex1.83.0-icu72 [sparc64]

paquet virtuel fourni par libboost-regex1.83.0
dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, hppa, ia64, sh4]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
dep: libccp4c0 (>= 8.0.0) [sparc64]

CCP4 core functionality - C runtime
dep: libcifpp1 (>= 1.0.1) [hppa]

Paquet indisponible
dep: libcifpp5 (>= 5.0.7.1) [non hppa]

Library files for libcifpp
dep: libclipper2 (>= 2.1.20201109)

object oriented library for crystallographic computing
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [sparc64]

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libgslcblas0 (>= 2.7.1) [sparc64]

GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package
dep: libnewuoa0 (>= 0.1.2) [sparc64]

Library file for libnewuoa
dep: libpdb-redo1 (>= 1.0.2-3~) [hppa]

Paquet indisponible
dep: libpdb-redo3 (>= 3.0.5) [non hppa]

Library file for libpdb-redo
dep: libstdc++6 (>= 11) [non riscv64, sh4, sparc64]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64, sh4, sparc64]
dep: libunwind8 [ia64]

bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable
dep: libzeep5.1 (>= 5.1.4) [hppa]

Library file for libzeep

dep: libzeep5.1 (>= 5.1.8) [non hppa]
dep: zlib1g (>= 1:1.2.2) [non hppa]

Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger density-fitness

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.0.8-4	447,6 ko	5 608,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.0.8-4	448,0 ko	5 548,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.0.8-4	443,8 ko	5 544,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.0.8-4	442,7 ko	5 531,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.0.8-4	443,1 ko	5 503,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.0.0-4	104,9 ko	359,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.0.8-4	452,0 ko	5 554,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.0.8-4	461,7 ko	5 675,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.0.8-4	444,3 ko	5 542,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.0.8-4	447,9 ko	5 615,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.0.8-4	449,3 ko	5 610,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.0.8-4	449,9 ko	5 608,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.0.8-4+b1	450,5 ko	5 537,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.0.8-4	444,2 ko	5 556,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.0.8-4	450,2 ko	5 542,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.0.8-4+b1	443,8 ko	6 445,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.0.8-4	446,8 ko	5 535,0 ko	[liste des fichiers]