Paquet : clustalx (2.1+lgpl-9 et autres)

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Ressources externes :

Page d'accueil [www.clustal.org]

Paquets similaires :

alignement multiple de séquences d'acides nucléiques et de protéines - interface graphique

Ce paquet offre une interface graphique utilisateur pour le programme Clustal d'alignement de plusieurs séquences. Il fournit un environnement intégré pour effectuer plusieurs alignements par séquence et par profil pour analyser les résultats. L'alignement de séquences est affiché dans une fenêtre sur l'écran. Un système de coloration souple a été intégré pour mettre en évidence les caractéristiques conservées dans l'alignement. Pour les présentations professionnelles, il convient d'utiliser le paquet texshade (LaTeX) ou boxshade .

Les menus déroulants en haut de la fenêtre permettent de sélectionner toutes les options nécessaires pour les traditionnels alignements par séquences multiples et par profil. Vous pouvez couper-coller les séquences pour changer l'ordre de l'alignement ; vous pouvez sélectionner un sous-ensemble de séquences à aligner ; vous pouvez sélectionner une sous-plage de l'alignement à réaligner et réinsérer dans l'alignement original.

Une analyse de la qualité de l'alignement peut être réalisée et les segments à faible score ou les résidus exceptionnels peuvent être mis en évidence.

Étiquettes: Biologie: Clustal et ALN, Protéines, Domaine: field::biology, field::biology:bioinformatics, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Interface utilisateur: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Champ d'application: Utilitaire, Boîte à outils d'interface utilisateur: LessTif ou Motif, uitoolkit::qt, use::analysing, But: Comparaison, use::viewing, works-with-format::plaintext, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire, Système X Window: Application

Autres paquets associés à clustalx

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libatomic1 (>= 4.8) [m68k]

bibliothèque de prise en charge fournissant des fonctions internes __atomic
dep: libc6 (>= 2.29) [m68k]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, m68k, sh4, x32]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [x32]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgl1 [m68k, sparc64]

bibliothèque de transport GL indépendante du fournisseur – prise en charge de l’ancienne GL
dep: libqt5core5a (>= 5.7.0) [m68k]

module principal de QT⋅5
dep: libqt5core5t64 (>= 5.15.1) [amd64, i386, x32]

module principal de QT⋅5

dep: libqt5core5t64 (>= 5.7.0) [non amd64, i386, m68k, x32]
dep: libqt5gui5 (>= 5.2.0) [m68k]

module Qt⋅5 d'interface graphique

ou libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)

Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant
dep: libqt5gui5t64 (>= 5.2.0) [non m68k]

module Qt⋅5 d'interface graphique

ou libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)

Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant
dep: libqt5widgets5 (>= 5.0.2) [m68k]

module de widgets de Qt⋅5
dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.0.2) [non m68k]

module de widgets de Qt⋅5
dep: libqt5xml5 (>= 5.0.2) [m68k]

Qt 5 XML module
dep: libqt5xml5t64 (>= 5.0.2) [non m68k]

Qt 5 XML module
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [non m68k]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k]
dep: libunwind8 [ia64]

bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

sug: boxshade

Rendu élégant d'alignements multiples de séquences
sug: clustalw

alignement de séquences de nucléotides ou de peptides
sug: texlive-latex-extra

TeX Live : paquets LaTeX supplémentaires

Télécharger clustalx

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2.1+lgpl-9+b1	405,8 ko	1 659,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2.1+lgpl-9+b1	445,0 ko	1 427,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.1+lgpl-9+b1	385,0 ko	1 334,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2.1+lgpl-9+b1	378,0 ko	1 262,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2.1+lgpl-9+b1	390,7 ko	962,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	2.1+lgpl-9+b1	419,9 ko	1 461,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2.1+lgpl-9+b1	474,3 ko	1 470,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	2.1+lgpl-9+b1	501,1 ko	2 574,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	2.1+lgpl-9	416,1 ko	1 369,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.1+lgpl-9+b1	395,1 ko	1 726,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	2.1+lgpl-9+b1	423,6 ko	1 782,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.1+lgpl-9+b1	428,8 ko	1 654,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.1+lgpl-9+b2	433,5 ko	1 130,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2.1+lgpl-9+b1	446,3 ko	1 470,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	2.1+lgpl-9+b1	506,1 ko	1 336,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	2.1+lgpl-9+b1	356,6 ko	2 179,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	2.1+lgpl-9+b1	444,7 ko	1 342,0 ko	[liste des fichiers]