Paquet : pbsim (1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3)

simulateur pour les lectures de séquences de PacBio

Les séquenceurs d’ADN PacBio produisent deux types de lectures caractéristiques : CSS (courtes et taux d’erreur bas) et CLR (longues et taux d’erreur haut), tous deux pouvant être utiles pour les assemblages de novo de génomes. PBSIM simule de telles lectures PacBio à partir d’une séquence de référence en utilisant soit une simulation basée sur un modèle ou basé un échantillonnage. Les lectures simulées sont utiles, par exemple, lors du développement ou l’évaluation d’assembleurs de séquences destinés aux données de PacBio.

Étiquettes: Biologie: Acides nucléiques, Domaine: Biologie, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Rôle: Programme, But: use::simulating, works-with::biological-sequence

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