Paquet : cwltool (3.1.20241024121129-1)

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Paquets similaires :

implémentation de la référence du langage Common Workflow

C'est l'implémentation de référence des standards de Common Workflow Language.

Les standards ouverts CWL servent à décrire des analyses de flux de travail et des outils afin de les rendre portables et déployabls sur une grande diversité d'environnements logiciels et matériels, des stations de travail aux clustrs en passant par le cloud et le calcul haute performance (HPC). CWL a été conçu pour satisfaire les besoins des scientifiques manipulant beaucoup de données comme la bioinformatique, l'imagerie médicaale, l'astronomie, la physique et la chimie.

L'implémentation de la référence CWL (cwltool) vise à être entièrement personnalisée et à offrir une validation exhaustive de fichiers CWL, mais aussi d'autres outils de travail avec des descriptions CWL.

Étiquettes: Administration système: Automatisation et ordonnancement, Virtualisation, Domaine: field::astronomy, field::biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:molecular, Biologie structurale, field::medicine, field::physics, Mis en œuvre en: Python, Interface utilisateur: interface::commandline, role::program, Sciences: Calcul, Champ d'application: Utilitaire, Class of system: system::cloud, system::laptop, Serveur, Virtual, But: use::analysing, use::filtering, Format pris en charge: Étiquette supplémentaire nécessaire, Fonctionne avec: works-with::semantic-data, works-with::software:package

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dep: python3

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complètement (Tab) de bash/zsh pour argparse – Python 3
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sortie colorée de terminal pour le module de connexion de Python 3
dep: python3-cwl-utils (>= 0.32)

Python Utilities and Autogenerated Classes for CWL v1.0 - v1.2
dep: python3-mypy-extensions

Experimental type system extensions for mypy typechecker (Python 3)
dep: python3-prov

W3C Provenance Data Model (Python 3)
dep: python3-psutil

module fournissant des fonctions pratiques pour la gestion de processus –⋅Python3
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interface Python pour dot de Graphviz
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Python 3 library containing an RDF triple store and RDF parsers/serializers
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bibliothèque HTTP simple et élégante pour Python3, construite pour les êtres humains
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Roundtrip YAML parser/emitter (Python 3 module)
dep: python3-schema-salad (>= 8.4.20230808163024)

Schema Annotations for Linked Avro Data (SALAD)
dep: python3-setuptools

Améliorations de Python3 Distutils
dep: python3-spython

Command line Python tool for working with Singularity

rec: nodejs

E/S par événement pour le moteur JavaScript V8

sug: cwltool-doc

Common Workflow Language reference implementation -- docs
sug: podman

tool to manage containers and pods

ou docker.io

Linux container runtime

ou singularity-container

plateforme de conteneur centré sur la prise en charge de « mobilité de calcul »

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