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[ Paquet source : snippy ]
Paquet : snippy (4.6.0+dfsg-4)
Liens pour snippy
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
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- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
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Télécharger le paquet source snippy :
Responsables :
Ressources externes :
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Paquets similaires :
rapid haploid variant calling and core genome alignment
Snippy finds SNPs between a haploid reference genome and your NGS sequence reads. It will find both substitutions (snps) and insertions/deletions (indels). It will use as many CPUs as you can give it on a single computer (tested to 64 cores). It is designed with speed in mind, and produces a consistent set of output files in a single folder. It can then take a set of Snippy results using the same reference and generate a core SNP alignment (and ultimately a phylogenomic tree).
Autres paquets associés à snippy
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Télécharger snippy
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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| all | 26,2 ko | 100,0 ko | [liste des fichiers] |