[ Paquet source : r-bioc-genomicalignments ]
Paquet : r-bioc-genomicalignments (1.42.0-1)
Liens pour r-bioc-genomicalignments
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source r-bioc-genomicalignments :
- [r-bioc-genomicalignments_1.42.0-1.dsc]
- [r-bioc-genomicalignments_1.42.0.orig.tar.gz]
- [r-bioc-genomicalignments_1.42.0-1.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [bioconductor.org]
Paquets similaires :
Paquet « expérimental »
Avertissement : ce paquet appartient à la distribution expérimentale
. Cela signifie qu'il peut être instable ou bogué et peut éventuellement causer des pertes de données. Assurez-vous de consulter le journal des modifications (changelog
) et les autres documentations existantes avant de l'utiliser.
BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments
This BioConductor package provides efficient containers for storing and manipulating short genomic alignments (typically obtained by aligning short reads to a reference genome). This includes read counting, computing the coverage, junction detection, and working with the nucleotide content of the alignments.
Autres paquets associés à r-bioc-genomicalignments
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- dep: libc6 (>= 2.4)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: r-api-4.0
- Paquet indisponible
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- dep: r-api-bioc-3.20
- paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics
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- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.37.0)
- generic functions for Bioconductor
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- dep: r-bioc-biocparallel
- BioConductor facilities for parallel evaluation
-
- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.55.7)
- GNU R string objects representing biological sequences
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- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.13.1)
- BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
-
- dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.55.3)
- BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
-
- dep: r-bioc-iranges (>= 2.23.9)
- conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers
-
- dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2)
- importation de fichiers BAM, BCF et tabix pour GNU R
-
- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.12)
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
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- dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.9.13)
- BioConductor assay container
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- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
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- sug: r-bioc-bsgenome
- infrastructure de BioConductor pour les paquets de données de génome basés sur Biostrings
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- sug: r-bioc-deseq2
- R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis
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- sug: r-bioc-edger
- analyse empirique de données numériques d’expressions de gène avec R
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- sug: r-bioc-genomicfeatures
- GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
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- sug: r-bioc-rtracklayer
- GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks
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- sug: r-bioc-shortread
- GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data
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- sug: r-cran-knitr
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
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- sug: r-cran-runit
- paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires
Télécharger r-bioc-genomicalignments
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| mips64el | 2 108,6 ko | 3 455,0 ko | [liste des fichiers] |