Paquet : fastx-toolkit (0.0.14-6)

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Le kit FASTX est une collection d'outils en ligne de commande pour le prétraitement des lectures de nucléotides courts dans les formats FASTA et FASTQ, habituellement produits par les machines de séquençage. Le principal traitement de ces fichiers FASTA/FASTQ est la cartographie (alignement) des séquences sur des génomes de référence ou autres bases de données à l'aide de programmes spécialisés tels que BWA, Bowtie et de nombreux autres. Cependant, il est parfois plus productif de prétraiter les fichiers FASTA/FASTQ avant d'aligner les séquences avec les génomes de référence ou de manipuler les séquences afin de produire de meilleurs résultats. Le kit FASTX réalise quelques-unes de ces tâches de prétraitement.

Étiquettes: Rôle: Programme

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enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [non armhf]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]
dep: libgd-graph-perl

module de tracé de graphe pour Perl 5
dep: libgtextutils0v5

Gordon Text_utils library
dep: libperlio-gzip-perl

module providing a PerlIO layer to gzip/gunzip
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C++ de GNU v3

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	109,8 ko	615,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	108,0 ko	553,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	104,6 ko	468,0 ko	[liste des fichiers]
i386	111,7 ko	604,0 ko	[liste des fichiers]