Paquet : samblaster (0.1.24-2)

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Paquets similaires :

marks duplicates, extracts discordant/split reads

Current "next-generation" sequencing technologies cannot tell what exact sequence they will be reading. They take what is available. And if some sequences are read very often, then this needs some extra biomedical thinking. The genome could for instance be duplicated.

samblaster is a fast and flexible program for marking duplicates in read-id grouped paired-end SAM files. It can also optionally output discordant read pairs and/or split read mappings to separate SAM files, and/or unmapped/clipped reads to a separate FASTQ file. When marking duplicates, samblaster will require approximately 20MB of memory per 1M read pairs.

Autres paquets associés à samblaster

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

dep: libc6 (>= 2.8) [armhf, i386]
dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libstdc++6 (>= 5)

bibliothèque standard C++ de GNU v3

Télécharger samblaster

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	22,8 ko	57,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	21,9 ko	57,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	20,7 ko	45,0 ko	[liste des fichiers]
i386	23,7 ko	57,0 ko	[liste des fichiers]