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Paquet : perm (0.4.0-4)

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efficient mapping of short reads with periodic spaced seeds

PerM is a software package which was designed to perform highly efficient genome scale alignments for hundreds of millions of short reads produced by the ABI SOLiD and Illumina sequencing platforms. Today PerM is capable of providing full sensitivity for alignments within 4 mismatches for 50bp SOLID reads and 9 mismatches for 100bp Illumina reads.

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armhf 109,0 ko216,0 ko [liste des fichiers]
i386 138,2 ko384,0 ko [liste des fichiers]