[ Paquet source : maffilter ]
Paquet : maffilter (1.3.1+dfsg-1 et autres)
Liens pour maffilter
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source maffilter :
- [maffilter_1.3.1+dfsg-1.dsc]
- [maffilter_1.3.1+dfsg.orig.tar.xz]
- [maffilter_1.3.1+dfsg-1.debian.tar.xz]
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Andreas Tille (Page QA)
- Julien Dutheil (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [jydu.github.io]
Paquets similaires :
process genome alignment in the Multiple Alignment Format
MafFilter applies a series of "filters" to a MAF file, in order to clean it, extract data and computer statistics while keeping track of the associated meta-data such as genome coordinates and quality scores.
* It can process the alignment to remove low-quality / ambiguous / masked regions. * It can export data into a single or multiple alignment file in format such as Fasta or Clustal. * It can read annotation data in GFF or GTF format, and extract the corresponding alignment. * It can perform sliding windows calculations. * It can reconstruct phylogeny/genealogy along the genome alignment. * It can compute population genetics statistics, such as site frequency spectrum, number of fixed/polymorphic sites, etc.
Autres paquets associés à maffilter
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- dep: libboost-iostreams1.67.0
- bibliothèque Boost.Iostreams
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- dep: libboost-regex1.67.0 (>= 1.67.0-10)
- Bibliothèque d'expressions rationnelles pour C++
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- dep: libbpp-core4 [non amd64]
- bibliothèque principale de Bio++
- dep: libbpp-core4 (>= 2.4.1) [amd64]
-
- dep: libbpp-phyl-omics3 (>= 2.4.1)
- bibliothèque de phylogénétique de Bio++ – composants génomiques
-
- dep: libbpp-phyl12 [non amd64]
- bibliothèque de phylogénétique de Bio++
- dep: libbpp-phyl12 (>= 2.4.1) [amd64]
-
- dep: libbpp-seq-omics3 [non amd64]
- bibliothèque de séquences pour Bio++ – composants génomiques
- dep: libbpp-seq-omics3 (>= 2.4.1) [amd64]
-
- dep: libbpp-seq12 [non amd64]
- bibliothèque de séquences pour Bio++
- dep: libbpp-seq12 (>= 2.4.1) [amd64]
-
- dep: libbz2-1.0
- Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)
-
- dep: libc6 (>= 2.1.3) [i386]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [non armhf]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Bibliothèque de compression - binaires
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- sug: maffilter-examples
- process genome alignment in the Multiple Alignment Format (example data)
Télécharger maffilter
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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amd64 | 1.3.1+dfsg-1+b1 | 210,3 ko | 847,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 1.3.1+dfsg-1+b1 | 189,9 ko | 795,0 ko | [liste des fichiers] |
armhf | 1.3.1+dfsg-1+b1 | 179,7 ko | 554,0 ko | [liste des fichiers] |
i386 | 1.3.1+dfsg-1+b1 | 213,4 ko | 806,0 ko | [liste des fichiers] |