Paquet : sibsim4 (0.20-4)

Alignement de séquences d'ARN sur une séquence d'ADN

Le projet SIBsim4 est basé sur sim4, un programme pour aligner une séquence d'ADNc sur une séquence génomique, en tenant compte de l'existence d'introns. Dans SIBsim4, le code source original a été fortement remanié avec comme buts :

 - l'amélioration de la vitesse ;
 - l'utilisation de séquences d'ADN de l'ordre de grandeur d'un
    chromosome ;
 - une meilleure description des variants d'épissage ;
 - une meilleure description des sites de polyadénylation ;
 - des corrections et améliorations de code.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: use::TODO, use::comparing, Recherche, Format pris en charge: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

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