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Paquet : bowtie2-examples (2.3.4.3-1)

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exemples pour bowtie2

Bowtie 2 est un outil ultra rapide et efficace en mémoire pour aligner des lectures de séquences de gènes avec de longues séquences de référence. Il est particulièrement bon pour aligner les lectures de 50 jusqu'à des centaines ou milliers de caractères, ainsi que pour aligner avec des génomes relativement longs, comme ceux des mammifères.

Bowtie 2 indexe le génome avec un FM-index pour garder une faible empreinte mémoire : pour le génome humain, son empreinte en mémoire vive est généralement d'environ 3,2 Go. Bowtie 2 gère les modes d'alignement « gapped », local, et par paire.

Ce paquet fournit des données d'exemples à utiliser avec Bowtie 2.

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