Paquet : emboss (6.6.0+dfsg-7 et autres)

Liens pour emboss

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source emboss :

Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [emboss.sourceforge.net]

Paquets similaires :

ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne

EMBOSS (« European Molecular Biology Open Software Suite ») est un paquet de logiciels d'analyse libre et gratuit, spécialement développé pour les besoins de la communauté d'utilisateurs de la biologie moléculaire (par exemple EMBnet – « European Molecular Biology network »). Le logiciel prend automatiquement en charge les données dans divers formats et permet même une recherche transparente des données de séquences à partir du web. De plus, comme des bibliothèques importantes sont fournies avec le paquet, il s'agit d'une plate-forme permettant aux autres scientifiques de développer et publier des logiciels dans l'esprit du libre. EMBOSS intègre également un ensemble de paquets actuellement disponibles et des outils pour l'analyse de séquences dans un tout cohérent. EMBOSS casse la tendance historique vers des logiciels commerciaux.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, field::biology:molecular, implemented-in::c, Interface utilisateur: Ligne de commande, Rôle: Programme, Champ d'application: scope::suite, scope::utility, But: Analyse, Comparaison, use::converting, use::editing, Gestion de données, Recherche, use::text-formatting, use::typesetting, Visualisation de données, Format pris en charge: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire, works-with::db, works-with::text

Autres paquets associés à emboss

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: emboss-data (= 6.6.0+dfsg-7)

fichiers de données pour le paquet EMBOSS
dep: emboss-lib (= 6.6.0+dfsg-7+b1)

EMBOSS Libraries
dep: libc6 (>= 2.15) [non arm64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
dep: libexpat1 (>= 2.0.1)

bibliothèque C d'analyse syntaxique XML - bibliothèque d'exécution
dep: libgd3 (>= 2.1.0~alpha~)

bibliothèque graphique GD
dep: libhpdf-2.3.0 (>= 2.3.0)

C library for generating pdf files
dep: libmariadb3 (>= 3.0.0)

bibliothèque du client de base de données MariaDB
dep: libpng16-16 (>= 1.6.2-1)

bibliothèque PNG –⋅exécutable (version⋅1.6)
dep: libpq5

bibliothèque C cliente pour PostgreSQL
dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

trousse à outils SSL - bibliothèques partagées
dep: libx11-6

Bibliothèque X11 partie client
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Bibliothèque de compression - binaires

rec: dialign

alignement de plusieurs séquences par segments
rec: primer3

outil de choix d'amorces l'amplification d'ADN

sug: clustalw

alignement de séquences de nucléotides ou de peptides
sug: embassy

Paquet indisponible
sug: emboss-doc

documentation pour EMBOSS
sug: emboss-test

fichiers de test pour le paquet EMBOSS

Télécharger emboss

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	6.6.0+dfsg-7+b1	1 047,8 ko	5 867,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	6.6.0+dfsg-7+b1	992,8 ko	4 838,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	6.6.0+dfsg-7+b1	992,4 ko	3 875,0 ko	[liste des fichiers]
i386	6.6.0+dfsg-7+b1	1 033,5 ko	5 495,0 ko	[liste des fichiers]