Paquet : bedtools (2.27.1+dfsg-4)

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Paquets similaires :

suite d'utilitaires pour la comparaison des caractéristiques de génomes

Les utilitaires BEDTools permettent de traiter les tâches génomiques ordinaires telles que trouver les chevauchements de caractéristiques et informatiser les données. Les utilitaires sont en grande partie basés sur quatre formats de fichier très utilisés : BED, GFF/GTF, VCF et SAM/BAM. En utilisant BEDTools, il est possible de développer des enchainements sophistiqués qui répondent à des questions de recherche en utilisant plusieurs outils séquentiellement.

L'outil groupBy est fourni par le paquet filo.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c++, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Ensemble, But: use::analysing, use::comparing, Conversion de données, use::filtering, works-with::biological-sequence

Autres paquets associés à bedtools

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.23)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:4.2)

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C++ de GNU v3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger bedtools

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
arm64	515,0 ko	1 803,0 ko	[liste des fichiers]