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Paquet : voronota (1.22.3149-1)

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Paquets similaires :

Voronoi diagram-based tool to find atom contacts

The analysis of macromolecular structures often requires a comprehensive definition of atomic neighborhoods. Such a definition can be based on the Voronoi diagram of balls, where each ball represents an atom of some van der Waals radius. Voronota is a software tool for finding all the vertices of the Voronoi diagram of balls. Such vertices correspond to the centers of the empty tangent spheres defined by quadruples of balls. Voronota is especially suitable for processing three-dimensional structures of biological macromolecules such as proteins and RNA.

Since version 1.2 Voronota also uses the Voronoi vertices to construct inter-atom contact surfaces and solvent accessible surfaces. Voronota provides tools to query contacts, generate contacts graphics, compare contacts and evaluate quality of protein structural models using contacts.

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Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 2 004,3 ko11 456,0 ko [liste des fichiers]
arm64 1 888,1 ko11 052,0 ko [liste des fichiers]
armel 1 817,2 ko10 829,0 ko [liste des fichiers]
armhf 1 852,4 ko9 965,0 ko [liste des fichiers]
i386 2 096,8 ko11 671,0 ko [liste des fichiers]
mips64el 1 876,1 ko12 452,0 ko [liste des fichiers]
mipsel 1 908,2 ko12 277,0 ko [liste des fichiers]
ppc64el 2 005,7 ko11 896,0 ko [liste des fichiers]
s390x 1 865,8 ko11 436,0 ko [liste des fichiers]