Paquet : smithwaterman (0.0+git20160702.2610e25-11)

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Paquets similaires :

determination de régions similaires entre deux chaines de séquences génomiques

L’algorithme de Smith–Waterman réalise un alignement de séquences, c’est-à-dire qu’il détermine les régions similaires entre deux chaines représentant des séquences de nucléotide ou de protéine. Au lieu d’examiner la séquence entière, l’algorithme de Smith–Waterman compare les segments de toutes les longueurs possibles et optimise les mesures de similarité.

Autres paquets associés à smithwaterman

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [non amd64, arm64, ppc64el]
dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

library for entropy measurement of byte streams
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C++ de GNU v3

Télécharger smithwaterman

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	12,9 ko	55,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	12,4 ko	55,0 ko	[liste des fichiers]
armel	12,1 ko	50,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	12,0 ko	46,0 ko	[liste des fichiers]
i386	13,3 ko	58,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	13,2 ko	56,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	13,1 ko	55,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	13,3 ko	99,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	12,6 ko	55,0 ko	[liste des fichiers]