Paquet : probcons (1.12-13)

Liens pour probcons

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source probcons :

Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [probcons.stanford.edu]

Paquets similaires :

alignement de séquences multiples basé sur la cohérence probabiliste

Ceci est un outil pour la génération d'alignements de séquences multiples de protéines. En utilisant une combinaison de techniques d'alignements basées sur la modélisation probabiliste et la cohérence, le logiciel PROBCONS a atteint les meilleures précisions des méthodes d'alignement à ce jour. Sur la base de données d'alignements de test de performance BAliBASE (« Benchmark ALIgnment dataBASE »), les alignements produits par le logiciel PROBCONS montrent une amélioration statistiquement significative sur les logiciels actuels, contenant une moyenne de plus de 7 % de colonnes alignées correctement que celles du logiciel T-Coffee, plus de 11 % de colonnes alignées correctement que celles du logiciel ClustalW, et plus de 11 % de colonnes alignées que celles du logiciel Dialign.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c++, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: use::comparing, works-with-format::plaintext, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

Autres paquets associés à probcons

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.27)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 9) [non armel, armhf]

sug: probcons-extra

Programmes optionnels pour le paquets probcons

enh: t-coffee

alignement multiple de séquences

Télécharger probcons

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	116,1 ko	375,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	108,4 ko	326,0 ko	[liste des fichiers]
armel	104,4 ko	345,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	102,5 ko	253,0 ko	[liste des fichiers]
i386	101,3 ko	365,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	128,4 ko	408,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	125,9 ko	413,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	135,3 ko	415,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	99,6 ko	374,0 ko	[liste des fichiers]