[ Paquet source : python-pauvre ]
Paquet : python3-pauvre (0.2.2-2)
Liens pour python3-pauvre
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
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Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Andreas Tille (Page QA)
- Étienne Mollier (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
QC and genome browser plotting Oxford Nanopore and PacBio long reads
Pauvre is a plotting package designed for nanopore and PacBio long reads.
This package currently hosts four scripts for plotting and/or printing stats.
pauvre marginplot Takes a fastq file as input and outputs a marginal histogram with a heatmap. pauvre stats Takes a fastq file as input and prints out a table of stats, including how many basepairs/reads there are for a length/mean quality cutoff. This is also automagically called when using pauvre marginplot pauvre redwood Method of representing circular genomes. A redwood plot contains long reads as "rings" on the inside, a gene annotation "cambrium/phloem", and a RNAseq "bark". The input is .bam files for the long reads and RNAseq data, and a .gff file for the annotation. pauvre synteny Makes a synteny plot of circular genomes. Finds the most parsimonius rotation to display the synteny of all the input genomes with the fewest crossings-over. Input is one .gff file per circular genome and one directory of gene alignments.
Autres paquets associés à python3-pauvre
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- dep: python3-tk
- Tkinter –⋅écriture d'applications Tk avec Python⋅3.x
Télécharger python3-pauvre
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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all | 50,0 ko | 279,0 ko | [liste des fichiers] |