Paquet : blasr (5.3.3+dfsg-5)

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Paquets similaires :

correspondance de lectures de séquençage de molécules simples

BLASR (« Basic local alignment with successive refinement ») est une méthode pour mettre en correspondance des lectures de séquençage de molécules simples avec un génome de référence. De telles lectures sont longues de plusieurs milliers de bases et les divergences entre elles et le génome sont dominées par les erreurs d'insertion et de suppression.

Autres paquets associés à blasr

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libblasr5.3.4 (>= 5.3.4+dfsg)

outils pour l'alignement de lectures PacBio sur des séquences cibles
dep: libc6 (>= 2.29)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libhdf5-cpp-103-1 (>= 1.10.5)

HDF5 - C++ runtime files - serial version
dep: libpbbam1.6.0 (>= 1.6.0+dfsg)

Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library
dep: libpbcopper1.8.0 (>= 1.8.0+dfsg)

data structures, algorithms, and utilities for C++ applications
dep: libpbseq

library for analyzing PacBio sequencing data
dep: libstdc++6 (>= 9)

bibliothèque standard C++ de GNU v3

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
ppc64el	218,1 ko	737,0 ko	[liste des fichiers]