Paquet : phast (1.5+dfsg-2)
Liens pour phast
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- Page d'accueil [compgen.cshl.edu]
Paquets similaires :
phylogenetic analysis with space/time models
PHAST is a software package for comparative and evolutionary genomics. It consists of about half a dozen major programs, plus more than a dozen utilities for manipulating sequence alignments, phylogenetic trees, and genomic annotations. For the most part, PHAST focuses on two kinds of applications: the identification of novel functional elements, including protein-coding exons and evolutionarily conserved sequences; and statistical phylogenetic modeling, including estimation of model parameters, detection of signatures of selection, and reconstruction of ancestral sequences.
PHAST does not support phylogeny reconstruction or sequence alignment, and it is designed for use with DNA sequences only (see Comparison).
Autres paquets associés à phast
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: liblapack3
- bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée
- ou liblapack.so.3
- paquet virtuel fourni par libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libpcre3
- ancienne bibliothèque d'expressions rationnelles compatible Perl 5 –⋅fichiers exécutables
Télécharger phast
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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mipsel | 2 051,4 ko | 30 367,0 ko | [liste des fichiers] |