Paquet : gromacs (2020.6-2)

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Simulateur de dynamique moléculaire avec outils d'analyse et de préparation

GROMACS est un paquet polyvalent pour faire de la dynamique moléculaire, comme la simulation d'équations newtoniennes du mouvement de systèmes de millions de particules.

Il a été créé en premier lieu pour les molécules biochimiques comme les protéines et les lipides qui ont beaucoup d'interactions covalentes compliquées, mais comme GROMACS est extrêmement rapide pour calculer les interactions non covalentes (qui souvent dominent les simulations), beaucoup de groupes l'utilisent aussi pour la recherche sur des systèmes non biologiques, comme les polymères.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Biologie structurale, field::chemistry, implemented-in::c, Interface utilisateur: Ligne de commande, interface::graphical, interface::x11, Rôle: Programme, Boîte à outils d'interface utilisateur: Bibliothèque X, Système X Window: Application

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simulateur de dynamique moléculaire GROMACS – données et documentation
dep: libc6 (>= 2.7)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgromacs5 (>= 2020.6)

GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C++ de GNU v3
dep: libx11-6

bibliothèque X11 partie client

rec: cpp

préprocesseur C GNU (cpp)

sug: pymol

système de graphismes moléculaires

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