Paquet : megahit (1.2.9-2)

Liens pour megahit

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source megahit :

Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [github.com]

Paquets similaires :

ultra-fast and memory-efficient meta-genome assembler

Megahit is an ultra-fast and memory-efficient NGS assembler. It is optimized for metagenomes, but also works well on generic single genome assembly (small or mammalian size) and single-cell assembly.

The software was praised in a Briefings in Bioinformatics 5/2020 review (DOI: 10.1093/bib/bbaa085).

Autres paquets associés à megahit

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: bzip2

compresseur de fichier par tri de blocs de grande qualité – utilitaires
dep: libc6 (>= 2.14)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgomp1 (>= 6)

bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 7)

bibliothèque standard C++ de GNU v3
dep: python3

langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
dep: python3-all

package depending on all supported Python 3 runtime versions
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger megahit

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1 011,9 ko	7 983,0 ko	[liste des fichiers]