[ Paquet source : simka ]
Paquet : simkamin (1.5.3-4)
Liens pour simkamin
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source simka :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
approximate comparative metagenomics method dedicated to NGS datasets
Simka is a de novo comparative metagenomics tool. Simka represents each dataset as a k-mer spectrum and compute several classical ecological distances between them.
The difference with Simka stands in the fact that SimkaMin outputs approximate (but very similar) results by subsampling the kmer space. With this strategy, and with default parameters, SimkaMin is an order of magnitude faster, uses 10 times less memory and 70 times less disk than Simka.
Autres paquets associés à simkamin
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
Télécharger simkamin
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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| all | 31,3 ko | 385,0 ko | [liste des fichiers] |