Paquet : openslide-tools (3.4.1+dfsg-5)

outils de manipulation et conversion pour OpenSlide

OpenSlide est une bibliothèque C fournissant une interface simple pour lire des images de lame de microscope, aussi appelées lames virtuelles.

Les images « Whole-slide », aussi appelées lames virtuelles (virtual slides), sont des images de grande taille et haute résolution utilisées en pathologie numérique. La lecture de ces images en utilisant les outils ou bibliothèques standard est un défi parce que ces outils sont classiquement utilisés pour des images pouvant être compressées ou décompressées confortablement en mémoire vive ou dans un fichier d’échange (swap). Les images de lames virtuelles dépassent couramment la taille de la RAM, occupant, non compressées, souvent des dizaines de gigaoctets. De plus, ces images ont plusieurs résolutions, et seulement une petite partie des données peuvent être nécessaires et cela dans une résolution particulière.

Cette bibliothèque actuellement prend en charge : – Aperio (.svs, .tif) ; – Hamamatsu (.vms, .vmu, .ndpi) ; – Leica (.scn) ; – MIRAX (.mrxs) ; – Sakura (.svslide) ; – Trestle (.tif) ; – Generic tiled TIFF (.tif).

Ce paquet fournit les outils en ligne de commande pour la manipulation de fichier.

Étiquettes: Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire

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