Paquet : eigensoft (7.2.1+dfsg-2)

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Paquets similaires :

reduction of population bias for genetic analyses

The EIGENSOFT package combines functionality from the group's population genetics methods (Patterson et al. 2006) and their EIGENSTRAT stratification method (Price et al. 2006). The EIGENSTRAT method uses principal components analysis to explicitly model ancestry differences between cases and controls along continuous axes of variation; the resulting correction is specific to a candidate marker's variation in frequency across ancestral populations, minimizing spurious associations while maximizing power to detect true associations. The EIGENSOFT package has a built-in plotting script and supports multiple file formats and quantitative phenotypes.

Autres paquets associés à eigensoft

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libblas3

implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée

ou libblas.so.3

paquet virtuel fourni par libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.29)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgsl25 (>= 2.6)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: liblapack3

bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée

ou liblapack.so.3

paquet virtuel fourni par libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: liblapacke (>= 3.9.0)

bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée de la bibliothèque⋅C
dep: perl

langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

rec: gnuplot

programme de tracé interactif en ligne de commande
un paquet virtuel est également fourni par gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	353,3 ko	2 751,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	323,6 ko	2 783,0 ko	[liste des fichiers]
armel	278,3 ko	2 754,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	269,9 ko	1 950,0 ko	[liste des fichiers]
i386	369,0 ko	2 780,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	358,3 ko	3 593,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	346,6 ko	3 382,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	363,7 ko	3 843,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	317,8 ko	3 055,0 ko	[liste des fichiers]