Paquet : cat-bat (5.2.2-1)

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Paquets similaires :

taxonomic classification of contigs and metagenome-assembled genomes (MAGs)

Contig Annotation Tool (CAT) and Bin Annotation Tool (BAT) are pipelines for the taxonomic classification of long DNA sequences and metagenome assembled genomes (MAGs/bins) of both known and (highly) unknown microorganisms, as generated by contemporary metagenomics studies. The core algorithm of both programs involves gene calling, mapping of predicted ORFs against the nr protein database, and voting-based classification of the entire contig / MAG based on classification of the individual ORFs. CAT and BAT can be run from intermediate steps if files are formatted appropriately.

Autres paquets associés à cat-bat

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	28,8 ko	180,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	28,8 ko	180,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	28,8 ko	180,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	28,8 ko	180,0 ko	[liste des fichiers]