Paquet : python3-biom-format (2.1.10-1 et autres)
Liens pour python3-biom-format
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source python-biom-format :
- [python-biom-format_2.1.10-1.dsc]
- [python-biom-format_2.1.10.orig.tar.xz]
- [python-biom-format_2.1.10-1.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [biom-format.org]
Paquets similaires :
format de matrice d'observation biologique (BIOM) – Python 3
Le format de fichiers BIOM (prononcé biome) est conçu pour être un format d'usage général pour représenter un échantillon biologique avec des tables de contingence d'observations. BIOM est un standard reconnu pour le projet Earth Microbiome et est un projet candidat du Genomics Standards Consortium.
Le format BIOM est conçu pour une utilisation générale dans de vastes disciplines de -omique comparative. Par exemple, dans les études de gènes marqueurs, l'utilisation principale de ce format est de représenter des tables OTU : dans ce cas, les observations sont des OTU et la matrice contient les comptes correspondant au nombre de fois que chaque OTU est observé dans chaque échantillon. Par rapport aux données de métagénomes, ce format servirait à représenter les tables de métagénomes : dans ce cas, les observations pourraient correspondre aux sous-systèmes SEED et la matrice contiendrait les comptes correspondant au nombre de fois que chaque sous-système est observé dans chaque métagénome. De même, pour les données de génome, ce format pourrait servir à représenter un ensemble de génomes : dans ce cas, les observations pourraient à nouveau correspondre aux sous-systèmes SEED et les comptes pourraient correspondre au nombre de fois que chaque sous-système est observé dans chaque génome.
Ce paquet fournit la bibliothèque du format BIOM pour l'interpréteur Python 3.
Autres paquets associés à python3-biom-format
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- dep: cython3
- extensions en⋅C pour Python⋅3
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- dep: libc6 (>= 2.4)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
- dep: python3 (<< 3.10)
- dep: python3 (>= 3.9~)
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- dep: python3-click
- Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
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- dep: python3-future
- prise en charge d’un source unique pour Python 3 et 2 – Python 3.x
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- dep: python3-h5py
- general-purpose Python interface to hdf5
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- dep: python3-h5py-serial
- general-purpose Python interface to hdf5 (Python 3 serial)
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- dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)
- gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3
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- dep: python3-numpy-abi9
- paquet virtuel fourni par python3-numpy
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- dep: python3-pandas
- structures de données pour des données « relationnelles » ou « étiquetées »
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- dep: python3-scipy
- outils scientifiques pour Python 3
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- dep: python3-six (>= 1.10.0)
- bibliothèque de compatibilité Python⋅2 et⋅3 –⋅interface Python⋅3
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- sug: python-biom-format-doc
- documentation pour le format BIOM
Télécharger python3-biom-format
| Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|---|
| armhf | 2.1.10-1+b1 | 121,9 ko | 664,0 ko | [liste des fichiers] |