Paquet : topp (2.6.0+cleaned1-3)

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Paquets similaires :

ensemble de programmes implémentant The OpenMS Proteomic Pipeline

TOPP (the OpenMS proteomic pipeline) est un pipeline d'analyse de données HPLC/MS. C'est un ensemble de nombreuses petites applications qu'on peut chaîner pour créer des pipelines d'analyse adapés à un problème particulier. Les applications utilisent la bibliothèque libopenms. Certains exemples de ces explications sont :

  - TOPPView : un visionneur de données spectométriques de masse.
  - TOPPAS : un assistant pour concevoir graphiquement des flux TOPP
  - DTAExtractor : extrait des spectres d'un fichier MS run en plusieurs fichiers
    au format DTA.
  - FileConverter :  Conversion entre divers formats de fichiers MS.
  - FileFilter : Extrait ou manipule des morceaux de données issues de fichiers peak,
    feature ou consensus feature.
  - SpectraMerger : Fusionne des spectres issus d'un plan LC/MS, en précurseur
    ou en blocs RT.
  - BaselineFilter : supprime la ligne d'un profil de spectre en utilisant un
    filtre top-hat.
  - InternalCalibration : Utilisé pour une calibration intrne.
  - PTModel : Entraîne un modèle de prédiction des peptides protéotypiques
    à partir d'un plan d'entraînement.
  - RTPredict : Prédit des temps de rétention pour des peptides en utilisant un
    modèle entraîné par RTModel.
  - ExecutePipeline : Exécute des flux de travail créés par TOPPAS.

Étiquettes: Boîte à outils d'interface utilisateur: Qt

Autres paquets associés à topp

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libboost-regex1.74.0-icu67

paquet virtuel fourni par libboost-regex1.74.0
dep: libc6 (>= 2.29)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgomp1 (>= 6)

bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-3)

library for LC/MS data management and analysis - runtime
dep: libqt5core5a (>= 5.11.3)

module principal de QT⋅5
dep: libqt5gui5 (>= 5.11.3)

module Qt⋅5 d'interface graphique

ou libqt5gui5-gles (>= 5.11.3)

Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant
dep: libqt5widgets5 (>= 5.11.3)

module de widgets de Qt⋅5
dep: libstdc++6 (>= 9)

bibliothèque standard C++ de GNU v3
dep: libxerces-c3.2

validating XML parser library for C++
dep: openms-common (= 2.6.0+cleaned1-3)

package for LC/MS data management and analysis - shared data

sug: openms-doc

package for LC/MS data management and analysis - documentation

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