Paquet : bio-vcf (0.9.5-2)
Liens pour bio-vcf
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source bio-vcf :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [rubygems.org]
Paquets similaires :
domain specific language (DSL) for processing the VCF format
Bio-vcf provides a domain specific language (DSL) for processing the VCF format. Record named fields can be queried with regular expressions, e.g.
sample.dp>20 and rec.filter !~ /LowQD/ and rec.tumor.bcount[rec.alt]>4
Bio-vcf is a new generation VCF parser, filter and converter. Bio-vcf is not only very fast for genome-wide (WGS) data, it also comes with a really nice filtering, evaluation and rewrite language and it can output any type of textual data, including VCF header and contents in RDF and JSON.
Autres paquets associés à bio-vcf
|
|
|
|
-
- dep: ruby
- interpréteur pour le langage de script orienté objet Ruby – version par défaut
- ou ruby-interpreter
- Paquet indisponible
Télécharger bio-vcf
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
---|---|---|---|
all | 25,1 ko | 119,0 ko | [liste des fichiers] |