Paquet : ncbi-blast+ (2.12.0+ds-3~bpo11+1)
Liens pour ncbi-blast+
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source ncbi-blast+ :
- [ncbi-blast+_2.12.0+ds-3~bpo11+1.dsc]
- [ncbi-blast+_2.12.0+ds.orig.tar.xz]
- [ncbi-blast+_2.12.0+ds-3~bpo11+1.debian.tar.xz]
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Olivier Sallou (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
- Aaron M. Ucko (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [www.ncbi.nlm.nih.gov]
Paquets similaires :
suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) est l'outil de similarité de séquences le plus répandu. Il existe des versions de BLAST qui comparent des séquences-test de protéine à des bases de données de protéines, des séquences-test de nucléotide à des bases de données de nucléotides, ainsi que des versions qui traduisent des séquences-test ou des bases de données de nucléotides dans tous les six cadres de lecture et les comparent à des bases de données de protéines ou à des séquences-test. PSI-BLAST produit une matrice de similarité d’alignement (PSSM — position-specific-scoring- matrix) à partir d’une séquence-test de protéine, puis utilise cette PSSM pour effectuer des recherches complémentaires. Il est aussi possible de comparer une séquence-test de protéine ou de nucléotide à une base de données de PSSM. NCBI gère une page web pour BLAST sur blast.ncbi.nlm.nih.gov ainsi qu'un service réseau.
Autres paquets associés à ncbi-blast+
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- dep: libbz2-1.0
- Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
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- dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)
- bibliothèque partagée Lightning Memory-Mapped Database
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- dep: libmbedcrypto3 (>= 2.13)
- lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library
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- dep: libmbedtls12 (>= 2.13)
- lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library
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- dep: libpcre3
- ancienne bibliothèque d'expressions rationnelles compatible Perl 5 –⋅fichiers exécutables
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- dep: libstdc++6 (>= 9)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: ncbi-data
- données indépendantes de la plateforme pour le kit de développement du NCBI
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- dep: perl
- langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)
- Bibliothèque de compression - binaires
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- enh: t-coffee
- alignement multiple de séquences
Télécharger ncbi-blast+
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| amd64 | 11 630,5 ko | 50 530,0 ko | [liste des fichiers] |
| arm64 | 10 656,3 ko | 49 133,0 ko | [liste des fichiers] |
| armel | 9 778,5 ko | 41 147,0 ko | [liste des fichiers] |
| armhf | 10 034,7 ko | 34 051,0 ko | [liste des fichiers] |
| i386 | 12 538,8 ko | 49 770,0 ko | [liste des fichiers] |
| mips64el | 8 651,3 ko | 56 164,0 ko | [liste des fichiers] |
| mipsel | 8 759,5 ko | 55 273,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64el | 11 722,6 ko | 61 676,0 ko | [liste des fichiers] |
| s390x | 10 465,5 ko | 50 756,0 ko | [liste des fichiers] |