Paquet : r-cran-sctransform (0.3.5-1)

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Variance Stabilizing Transformations for Single Cell UMI Data

A normalization method for single-cell UMI count data using a variance stabilizing transformation. The transformation is based on a negative binomial regression model with regularized parameters. As part of the same regression framework, this package also provides functions for batch correction, and data correction. See Hafemeister and Satija 2019 <doi:10.1101/576827> for more details.

Autres paquets associés à r-cran-sctransform

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libblas3

implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée

ou libblas.so.3

paquet virtuel fourni par libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.29)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, ppc64el]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: liblapack3

bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée

ou liblapack.so.3

paquet virtuel fourni par libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 9) [non armel, armhf]
dep: r-api-4.0

paquet virtuel fourni par r-base-core
dep: r-base-core (>= 4.2.1-2)

noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques
dep: r-cran-dplyr

GNU R grammar of data manipulation
dep: r-cran-future

R package: A Future API for R
dep: r-cran-future.apply

apply function to elements in parallel using futures
dep: r-cran-ggplot2

implementation of the Grammar of Graphics
dep: r-cran-gridextra

GNU R package with extensions for the grid package
dep: r-cran-magrittr

GNU R forward-pipe operator
dep: r-cran-mass

paquet GNU R pour MASS de Venables et Ripley
dep: r-cran-matrix (>= 1.5-0)

paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses
dep: r-cran-matrixstats

GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix
dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0)

GNU R package for Seamless R and C++ Integration
dep: r-cran-rcpparmadillo

GNU R package for Armadillo C++ linear algebra library
dep: r-cran-reshape2

Flexibly reshape data: a reboot of the reshape package
dep: r-cran-rlang

Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features

rec: r-cran-testthat

GNU R testsuite

sug: r-cran-irlba

GNU R fast truncated SVD, PCA and symmetric eigendecomposition
sug: r-cran-knitr

GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

Télécharger r-cran-sctransform

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	479,0 ko	726,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	467,4 ko	758,0 ko	[liste des fichiers]
armel	469,9 ko	756,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	469,1 ko	692,0 ko	[liste des fichiers]
i386	483,2 ko	732,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	465,7 ko	769,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	468,0 ko	763,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	476,4 ko	823,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	471,4 ko	730,0 ko	[liste des fichiers]