Paquet : python3-cyvcf2 (0.30.18-1 et autres)
Liens pour python3-cyvcf2
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source cyvcf2 :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Steffen Moeller (Page QA)
- Liubov Chuprikova (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
VCF parser based on htslib (Python 3)
This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.
cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.
This package installs the library for Python 3.
Autres paquets associés à python3-cyvcf2
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- dep: libc6 (>= 2.17)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.12)
- dep: python3 (>= 3.11~)
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- dep: python3-click
- Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
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- dep: python3-coloredlogs
- sortie colorée de terminal pour le module de connexion de Python 3
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- dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0)
- gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3
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- dep: python3-numpy-abi9
- paquet virtuel fourni par python3-numpy
Télécharger python3-cyvcf2
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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ppc64el | 0.30.18-1+b2 | 778,0 ko | 4 853,0 ko | [liste des fichiers] |