[ Paquet source : nanopolish ]
Paquet : nanopolish (0.14.0-1)
Liens pour nanopolish
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
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Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
identification de consensus pour les données de séquençage par nanopore
Nanopolish uses a signal-level hidden Markov model for consensus calling of nanopore genome sequencing data. It can perform signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate an improved consensus sequence for a draft genome assembly, detect base modifications, call SNPs and indels with respect to a reference genome and more.
Autres paquets associés à nanopolish
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
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- dep: libhdf5-103-1
- HDF5 C runtime files - serial version
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- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: libslow5-0 (>= 0.5.1+dfsg)
- library for reading & writing SLOW5 files
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- dep: libstdc++6 (>= 11)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: libstreamvbyte0 (>= 0.4.1)
- fast integer compression in C using the StreamVByte codec
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- dep: perl
- langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Bibliothèque de compression - binaires
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- rec: python3-biopython
- bibliothèque de Python 3 pour la bio-informatique
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- rec: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
Télécharger nanopolish
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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| arm64 | 2 084,4 ko | 9 218,0 ko | [liste des fichiers] |